Xã Phong Du Thượng là một trong các xã của huyện Văn Yên, tỉnh Yên Bái. Xã nằm ở phía đông của huyện, giáp ranh với xã Phong Du, xã Minh Quán và xã Yên Phú. Diện tích của xã là khoảng 18,7 km² và có độ cao trung bình là 700 mét so với mực nước biển.
Xã Phong Du Thượng có khí hậu ôn đới, mưa nhiều vào mùa hè và khô hơn vào mùa đông. Dân số của xã là khoảng 3.000 người, chủ yếu là người dân tộc H'Mông.
Xã Phong Du Thượng có nhiều danh lam thắng cảnh đẹp như thác nước, hang động và đồi núi. Một số điểm đến nổi tiếng ở đây bao gồm hang Tả Phìn, hang Cán Tình và thác nước Cán Tình.
Đặc sản của xã Phong Du Thượng bao gồm rượu ngô, thịt heo quay, cá nướng và các loại rau củ đặc trưng của vùng núi.