Xã Thanh Quân là một xã thuộc Huyện Như Xuân, Tỉnh Thanh Hóa, Việt Nam. Xã nằm ở phía đông nam của huyện và có diện tích khoảng 12,68 km². Khí hậu ở xã Thanh Quân có đặc điểm của khí hậu nhiệt đới ẩm gió mùa, với nhiệt độ trung bình là 24,7°C.
Theo thống kê của năm 2019, dân số của xã là khoảng 4.925 người. Xã Thanh Quân có nhiều danh lam thắng cảnh nổi tiếng như đèo Mã Pí Lèng, hang Sơn Dương, động Thiên Đường. Đặc sản của xã là thịt gà chọi, cơm lam và rượu cần.