Xã Nga Yên nằm ở phía Tây nam của Huyện Nga Sơn, Thanh Hóa. Diện tích của xã là khoảng 12,98 km² với khí hậu ôn đới và có độ cao trung bình 250m so với mực nước biển. Dân số của xã Nga Yên là khoảng 2.500 người.
Nga Yên được biết đến với nhiều danh lam thắng cảnh như thác Bản Vẽ, thác Giang Sơn, thác Nhổn, hang động Nga Yên và đặc biệt là đền thờ Bà Chúa Xứ Nga Yên - một trong những địa điểm du lịch nổi tiếng của Thanh Hóa.
Ngoài ra, xã Nga Yên còn có nhiều đặc sản như rượu cần, cá đồng, gà nòi và các loại rau củ quả trồng trên đất đỏ mùn của vùng núi.
Có 82 doanh nghiệp tại Xã Nga Yên, Huyện Nga Sơn, Thanh Hóa